Rによる作図
Rはオープンソースの統計処理ソフトウェアです.
Ross IhakaさんとRobert Clifford Gentlemanさんによって開発されたR言語の実装にあたります.
このページでは,Rの作図についてメモしています.
目次
散布図
ベクトルv1
とv2
の関係性を散布図で確かめるには,plot()
を使います.
plot(v1, v2) |
描く範囲を指定する場合,xlim = c(下限, 上限), ylim = c(下限, 上限)
のオプションを加えます.
図による理解を助けるため,図に書き込むための関数がいくつか用意されています.
points(x座標, y座標, cex = 半径) # 円の挿入 |
散布図行列
変数間の関係性を表した散布図行列はpairs
で描くことができます.
pairs(x) |
scatterplotMatrix()
car
パッケージのscatterplotMatrix()
はpairs()
と同様のformula式で散布図行列を描きます.
対角線上には,各変数のヒストグラムが入り,散布図に近似曲線が追記されます.
ヒストグラム
hist(x) |
probability=T
オプションで相対度数による表示.
breaks
で階級を割る数を指定できます.
棒グラフ
barplot(x) |
箱髭図
箱髭図は棒グラフよりも値の散らばりに関する情報が豊富です.
boxplot(x) |
髭の長さを規定するオプションはrange = 1.5
がデフォルト.
range > 0のとき,髭はQ3 + range * (Q3-Q1)までと設定されています.(range=0
なら髭はデータの最端点.)
formula式(y~x
)も使えます.
ビーンプロット
ビーンプロットは箱髭図よりも密度の情報が豊富です.
パッケージをインストールして使います.
install.packages("beanplot") |
コマンドは,
beanplot(x) |
の形です.
formula式(y~x
)も使えます.
Q-Qプロット
Q-Q(Quantile-Quantile)プロットは手元のデータが理論分布に従っているかを確認するためのプロットです.
次は正規分布の散らばりになっているかを描く例です.
qqnorm(y) |
交互作用
interaction.plot(横軸にするベクトル, 線を引き分ける項目のベクトル, 縦軸にするベクトル) |
相関プロット
corrplot
パッケージを使用する例です.
階層クラスタでの変数の類似度に従って行・列を並び替えた上で相関プロットを行うには,
corrplot(相関行列, order="hclust") |
とします.
曲線
curve(関数, from, to) # 例えば,curve(dnorm(x), from = -3, to = 3) |
重ね書きするなら,add=True
のオプションを入れます.
3次元プロット
persp(x, y, z, theta = 30, phi = 30, expand = 0.8)) # theta, phiは立体の投影角度,expandは拡大率 |
等高線
contour(データ) |
ファイル出力
グラフは書き出すことができます.
以下,png出力する例です.
png("ファイル名", width = 幅, height = 高さ) # 作図デバイスの指定 |
他にpdf
関数やjpeg
関数,TeXファイルにするpictex
関数などもあります.
参考文献
Rの概説書です.
- 舟尾暢男 (2016)「The R Tips ― データ解析環境Rの基本技・グラフィックス活用集」3版,オーム社.